佳木斯大学院系设置如下:
| 学院名称 | 专业名称 |
| 口腔医学院 | 口腔医学 |
| 材料科学与工程学院 | 焊接技术与工程 |
| 材料成型及控制工程 | |
| 材料类 | |
| 外国语学院 | 日语 |
| 英语 | |
| 俄语 | |
| 俄语 | |
| 朝鲜语 | |
| 英语 | |
| 理学院 | 数学类 |
| 物理学类 | |
| 化学类 | |
| 地理科学类 | |
| 环境科学 | |
| 机械工程学院 | 机械类 |
| 能源动力类 | |
| 轻工类 | |
| 交通运输类 | |
| 农业工程类 | |
| 信息电子技术学院 | 仪器类 |
| 电气类 | |
| 电子信息类 | |
| 计算机类 | |
| 生物医学工程类 | |
| 自动化 | |
| 建筑工程学院 | 建筑类 |
| 土木类 | |
| 经济与管理学院 | 工商管理类 |
| 物流管理与工程类 | |
| 电子商务类 | |
| 旅游管理类 | |
| 国际经济与贸易 | |
| 生命科学学院 | 生物科学类 |
| 林学类 | |
| 动物医学类 | |
| 人文学院 | 中国语言文学类 |
| 法学类 | |
| 马克思主义理论类 | |
| 历史学 | |
| 汉语言文学 | |
| 教育科学学院 | 教育学类 |
| 心理学 | |
| 基础医学院 | 医学技术类 |
| 护理学类 | |
| 临床医学 | |
| 公共卫生学院 | 预防医学 |
| 药学院 | 药学 |
| 制药工程 | |
| 化学工程与工艺 | |
| 药物分析 | |
| 商学院 | 网络与新媒体 |
| 音乐学院 | 音乐学 |
| 音乐表演 | |
| 舞蹈编导 | |
| 美术学院 | 美术学类 |
| 设计学类 | |
| 绘画 | |
| 视觉传达设计 | |
| 环境设计 | |
| 工艺美术 | |
| 体育学院 | 体育学类 |
| 旅游管理学院 | 旅游管理 |
| 国际教育学院 | 工商管理 |
| 国际经济与贸易 | |
| 会计学 | |
| 计算机科学与技术 | |
| 学前教育 | |
| 检验医学院 | |
| 护理学院 | |
| 医学院 | |
| 警官职业学院 | |
学校师资力量雄厚,现有教职工4719人(含3个附属医院),其中高级职称1607人,省级教学名师5人,省级优秀研究生导师团队2个,省科技创新团队2个;拥有共享“两院”院士、龙江学者等一批特聘教授和客座教授;现有来自全国31个省、市、自治区的全日制本科在校生23569人,博、硕研究生1376人,留学生1004人,继续教育生12853人;固定资产总值13.48亿元,其中教学仪器设备总值2.48亿元,图书馆藏书249.9万册。
学校坚持以育人为根本,以教学为中心,大力实施本科教学工程,深化教学改革,创新人才培养模式,调整专业结构布局,全面实施大类招生培养,学生的综合素质和创新、创业、就业能力不断增强。
学校坚持以学科建设为龙头,省、校、院三级重点学科协调发展,学科建设水平稳步提高,学科综合优势进一步彰显。学校主持国家“973计划”、“863计划”项目,国家自然科学基金、社会科学基金项目,国家科技支撑计划项目,卫生部、教育部和国家民委项目等各级、各类多项课题。在耐磨材料、药物研发、农机工程等研究领域取得了数十项国家发明专利,科技成果转化工作取得新进展,服务经济社会发展的能力不断提升。