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黑龙江中医药大学院系设置如下：
| 院系设置 | ||
| 基础医学院 | 药学院 | 临床医学院（附属第一医院） |
| 针灸推拿学院（附属第二医院） | 成人教育学院 | 国际教育学院 |
| 人文与管理学院 | 马克思主义学院 | 佳木斯学院 |
| 研究生院 |
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学校现有教职工3184人(校本部1181人)。其中教授、副教授及相应职称人员887名，博士生导师114人，硕士生导师375人，有45位专家享受政府特殊津贴，卫生部有突出贡献中青年专家2名，百千万人才工程国家级人选4人，国医大师1名，国家教学名师3名，全国先进工作者1名，巾帼建功标兵1名，全国模范教师1名，全国优秀教师6名，现有长江学者讲座教授1人，龙江学者特聘教授13人，“千人计划”入选者1人，国家教学团队3个，省教学团队5个，省教育厅科技创新团队7个。
学校拥有省内唯一一家药物安全性评价中心，建立了黑龙江省中药材GAP研究中心;为“省医药工业校企合作专业委员会”牵头单位，与多家企业合作，成立了黑龙江中医药大学久久药业和黑龙江宝泉制药有限公司等校企联合的科技实业;建成了占地100万平方米的黑龙江中医药大学清河中药材种子种苗繁育基地，并在黑龙江省14个市、县建成中药材GAP示范基地。
学校具有接收外国留学生和港澳台学生学历教育资格，是教育部首批批准招收来华留学生院校之一，已同世界上30多个国家和地区的40多所医学院校或研究机构开展了教育、医疗、科技合作与交流，目前学校长期国际合作项目140项，接受国外来访学者500多人，培养外国留学生及港澳台学生5000多人。多次承办大型国际学术会议，连续举办了十届“中俄药学论坛”、二届中匈双边医药学术研讨会及首次中德睡眠研究学术讨论会，开办“龙江中医讲坛”。我校与英国伦敦南岸大学、哈尔滨师范大学联合在英国伦敦创办的世界首家中医孔子学院连续五次被评为“先进孔子学院”称号，2012年4月李长春出席我校中医孔子学院成立5周年庆典。2014年3月我校与美国中药联商会合作创办的黑龙江中医药大学美国分校正式成立，成为全球首个在海外开设中药学学士学位课程的机构。
直接判断、特殊赋值、特例反驳、选项分组、巧用推论、筛选法、比较分析、等效思维、信息特征等...
