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首都医科大学院系设置如下：
| 院系设置 | ||
| 基础医学院 | 护理学院 | 公共卫生学院 |
| 燕京医学院 | 化学生物与药学院 | 全科医学与继续教育学院 |
| 生物医学工程学院 | 国际学院 | 中医药学院 |
| 卫生管理与教育学院 |
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截至2014年3月，学校和附属医院有教职员工和医务人员35128人(校本部1560人，附属医院33568人)。有院士6人，特聘顾问11人，正高职称1875人，副高职称3275人。其中教授667人(校本部88人，附属医院579人)，副教授1108人(校本部196人，附属医院918人);博士生导师362人(校本部80人，附属医院282人)，硕士生导师745人(校本部111人，附属医院634人)。有3个教育部创新团队，1个科技部优秀创新团队。
专职院士
中国科学院院士：汪忠镐、赵继宗
中国工程院院士：张金哲、胡亚美、韩德民、王辰
教育部创新团队
鼻病基础和临床研究(张罗)、帕金森病的基础与临床研究(陈彪)、主动脉瘤的转化医学研究(杜杰)等。
科技部优秀创新团队
缺血性脑血管病研究团队(王拥军)。
直接判断、特殊赋值、特例反驳、选项分组、巧用推论、筛选法、比较分析、等效思维、信息特征等...
