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济宁医学院是山东省普通本科高等学校，创建于1952年，占地总面积1244226.22平方米，现有济宁和日照两个校区，建筑面积674144.55平方米。学校固定资产总值9.45亿元，其中教学科研仪器设备总值1.9亿元，馆藏图书总量为150余万册。学校有11所附属医院，150余个实践教学基地。2008年4月学校以“优秀”成绩顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估。

学校有在职教工1075人，其中专任教师875人，教授、副教授328人，有硕士以上学位教师567人，聘有兼职教授446人。教师队伍中，有全国劳动模范、全国五一劳动奖章获得者、国家级教学名师、全国优秀教师、享受国务院政府特殊津贴人员、中青年突出贡献专家、泰山学者海外特聘专家等50余名。

学校面向全国25个省、市、自治区招生，现有全日制在校生16000余人。有计划的招收部分国家或地区留学生。
学校有16个教学单位：基础学院、临床学院、公共卫生学院、精神卫生学院、护理学院、法医学与医学检验学院、药学院、信息工程学院、管理学院、口腔医学系、医学影像学系、生物科学系、外语系、社会科学部、继续教育学院等。开设临床医学、临床医学（精神病与精神卫生方向）、中西医临床医学、康复治疗学、法医学、预防医学、食品质量与安全、护理学、医学检验技术、卫生检验与检疫、口腔医学、医学影像学、应用心理学、生物技术、生物工程、生物医学工程、药学、中药学、药物制剂、计算机科学与技术、信息管理与信息系统、市场营销、公共事业管理、劳动与社会保障、英语等30多个本专科专业和专业方向。学校已形成以医学教育为主体，涵盖医、理、工、管、文五个学科门类，本科教育和研究生教育、继续教育、留学生教育、中外合作办学协调发展的多层次办学格局。

学校设有临床医学一级学科专业硕士学位授权点。学校的临床医学专业、预防医学专业为教育部高等学校特色专业；临床医学（精神病与精神卫生方向）、护理学专业、药学专业为省级特色专业。医学免疫学被评为国家级精品课程，医学检验基础课程群和护理学专业急危重症课程群被评为省级精品课程群，共有23门省级精品课程。病理学与病理生理学、神经病学、免疫学、心血管疾病研究诊疗中心、神经内科学为山东省重点学科。学校现有行为医学、神经生物学、心脏疾病诊疗、职业卫生与环境医学等省级重点实验室和行为与健康省级人文社科研究基地。建立国际合作实验室、校级重点学科、重点实验室12个；有山东省行为医学研究所、神经生物学研究所、肿瘤病理研究所等28个研究机构。

近年来，学校共承担各级各类课题500余项，其中国家自然科学基金、省自然科学基金、省科技攻关课题、国家科技部“十一五”支撑计划、973、863项目子课题、国际合作项目百余项。在国内外学术期刊发表学术论文3000余篇。

中华医学会行为医学分会和山东省行为医学专业委员会挂靠我校，学校主办的全国中文核心期刊——《中华行为医学与脑科学杂志》和《济宁医学院学报》，面向国内外公开发行。《中华行为医学与脑科学杂志》2012年被评为中国权威学术期刊，名列基础医学类期刊第一名。

学校十分重视对外交流与合作，长期以来我校与美国麻省医药学院、瑞典卡罗林斯卡医学院、台湾慈济大学医学院等10多所国家和地区的高等学校、医院和科研单位建立了长期合作关系。在教学、科研、医疗、师资培养等各个方面进行了卓有成效的合作和交流。2011年，学校与美国孟菲斯大学合作举办护理专业教育国际合作项目。
近年来，普通本专科毕业生就业率保持在92%以上，研究生考取率位同类院校前列。

学校已连续26年被山东省人民政府授予“省级文明单位”，连续29年被济宁市人民政府授予“市级文明单位”，近年来，先后被授予山东省“省级文明校园”、“山东省德育工作优秀高校”、“山东省大学生思想政治教育先进单位”。