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山西医科大学创建于1919年，前身是山西医学传习所。在旧中国动荡的岁月里，学校多次易名，多次迁址。1932年1月，改为私立山西川至医学专科学校。1940年3月，更名为山西大学医学专修科。1946年8月，升格为国立山西大学医学院。新中国成立后，学校步入了一个崭新的发展时期。1953年9月，独立建校，更名为山西医学院。1955年全国高校院系调整时，山西、江苏、山东、浙江四所医学院的卫生系合并组建了山西医学院卫生系，成为全国保留有卫生系的六所高等医学院校之一，并由全国著名卫生学专家、国家一级教授、原江苏医学院院长邵象伊担任院长。1996年4月，更名为山西医科大学。
   
校本部占地总面积1864亩（含新校区1200亩），建筑总面积41.68万平方米；固定资产总值23284.87万元，其中教学科研仪器设备总值11047.56万元；图书资料150万册，与国内900多个单位建立了内部图书资料交换关系。
   
校本部在编教职工1643人，专任教师934人。现有博士研究生导师43人，硕士研究生导师725人（含博士研究生导师43人），享受国务院特殊津贴专家91人，国家级有突出贡献专家2人，教育部新世纪优秀人才3人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选2人，“新世纪学术技术带头人333人才工程”省级人选24人，中央联系的高级专家5人，省委联系的高级专家47人，省级教学名师12人。
   
学校生源来自全国20多个省、市、自治区。校本部现有普通高等教育在校生9887人，其中，博士生132人，硕士生2556人，本科生7199人；成人高等教育学生6897人。建校以来，学校培养了以全国首枚“白求恩奖章”获得者、“人民的好医生”赵雪芳为代表的医药卫生专业人才近4万名。近年来，学校积极调整人才培养层次结构，不断深化教学改革，人才培养质量逐步提高，本科生考研率保持在30％左右，毕业生就业率保持在80％左右。
   
经过九十年的建设与发展，学校已由初创时的单一学科，发展成为以医学为主，医、理、管、法、文多学科相互渗透、协调发展的医科大学，形成了以本科教育为主的多层次人才培养体系。无论是办学规模、办学质量、办学效益，还是师资队伍、教学科研能力、管理水平在全国同类院校中均具有一定优势。2006年，学校接受了教育部本科教学工作水平评估，被评为优秀。
学校现有第一临床医学院、第二临床医学院、汾阳学院、基础医学院、公共卫生学院、药学院、法医学院、护理学院、研究生学院、人文社会科学学院、继续教育学院、职业技术学院12个二级学院，晋祠学院1所独立学院，口腔医学系、儿科医学系、麻醉学系、医学影像学系、外语系、信息管理系、体育教学部、计算机教学部8个直属系部，10所附属医院，115个其它教学基地。
校本部设有临床医学（五年制、七年制）、预防医学、法医学、口腔医学、医学影像学、麻醉学、护理学、药学、中药学、药物制剂、社会工作、信息管理与信息系统（医药方向）、公共事业管理（卫生事业管理方向）、英语（医学方向）14个本科专业。其中，七年制临床医学专业是山西省唯一的长学制专业。
   
学校生理学为国家重点学科，有4个省重点学科、5个省重点建设学科、2个省重点扶持学科、2个国家级特色专业建设点、1个山西省特色专业、7个省级品牌专业；细胞生理学实验室为省部共建教育部重点实验室，有2个省重点实验室、2个省级研究中心、4个省级示范实验室。学校是全国首批硕士学位、学士学位授权单位，山西省首批博士学位授权单位，全国临床医学专业硕士学位、公共卫生专业硕士学位试点单位。现有2个博士后科研流动站，7个二级学科具有博士学位授予权，5个一级学科、53个二级学科具有硕士学位授予权。
   
学校在“十五”期间，共承担省部级及以上科研项目746项，总经费4993.36万元。其中，国家自然科学基金项目19项，获资助经费326万元；发表科研论文6057篇，其中《Nature》杂志发表1篇，国家级期刊3032篇，被SCI、ISTP收录228篇；出版教材及专著675部；获各种科技奖励249项，其中省科技进步奖146项（一等奖13项）、省高校科技进步奖39项（一等奖18项）。学校主办有《山西医科大学学报》、《中西医结合心脑血管病》、《护理研究》、《实用急救医学》等多种学术刊物。
   
附属第一医院、第二医院是山西省规模最大的综合性三级甲等医院，全国百姓放心医院，共开放床位2556张。附属第三医院是二级甲等医院，全国百姓放心示范医院，开放床位200张，开设有神经内科、甲状腺、精神卫生、肝胆外科、肿瘤等特色学科。附属口腔医院是省内唯一一所三级乙等口腔专科医院，开放床位20张、牙科综合治疗台64台。
   
学校与美国、日本、德国、意大利、澳大利亚、香港、台湾等国家和地区多所院校建立了教育、科技、医疗合作关系。
   
经过九十年的薪火相传，经过几代人的艰辛拼搏，山西医科大学取得了辉煌的成就。在未来的征程中，学校将继承优良办学传统，加快发展步伐，为把学校建设成多学科、有特色、高水平，位居国内同类院校前列的教学研究型医科大学而努力。